Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd2Q9Z2E1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd2Q9Z2E1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms