Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms