Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx39bQ9Z1N5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddx39bQ9Z1N5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms