Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms