Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog1Q9Z160 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog1Q9Z160 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms