Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb6Q9Z0T9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb6Q9Z0T9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms