Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clip2Q9Z0H8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms