Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stxbp4Q9WV89 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stxbp4Q9WV89 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stxbp4Q9WV89 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms