Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Atp1a4Q9WV27 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Atp1a4Q9WV27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atp1a4Q9WV27 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atp1a4Q9WV27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Atp1a4Q9WV27 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1a4Q9WV27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a4Q9WV27 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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