Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pus1Q9WU56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms