Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms