Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb3Q9R1P1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms