Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mpdu1Q9R0Q9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms