Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf346Q9R0B7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf346Q9R0B7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms