Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmfrQ9R049 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms