Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf4Q9QZS2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf4Q9QZS2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms