Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a3Q9QZS0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a3Q9QZS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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