Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms