Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn8Q9QZ49 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms