Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tnnt3Q9QZ47 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms