Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms