Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Tomm40Q9QYA2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tomm40Q9QYA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tomm40Q9QYA2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tomm40Q9QYA2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tomm40Q9QYA2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms