Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms