Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx8Q9QXV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms