Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip3Q9QXT8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms