Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sall2Q9QX96 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sall2Q9QX96 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall2Q9QX96 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms