Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyth1Q9QX11 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyth1Q9QX11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms