Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rai2Q9QVY8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rai2Q9QVY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms