Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Reg3dQ9QUS9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Reg3dQ9QUS9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Reg3dQ9QUS9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Reg3dQ9QUS9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Reg3dQ9QUS9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Reg3dQ9QUS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms