Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma6Q9QUM9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms