Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc2lQ9JME7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms