Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rabgef1Q9JM13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rabgef1Q9JM13 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rabgef1Q9JM13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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