Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tlr5Q9JLF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms