Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prg3Q9JL95 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms