Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot9Q9JKY0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms