Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arl6ip1Q9JKW0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arl6ip1Q9JKW0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms