Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pole3Q9JKP7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole3Q9JKP7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms