Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clec6aQ9JKF4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec6aQ9JKF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms