Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem1Q9JKE2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem1Q9JKE2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem1Q9JKE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms