Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms