Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap4m1Q9JKC7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms