Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ybx3Q9JKB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ybx3Q9JKB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ybx3Q9JKB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms