Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms