Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW0

Pxmp4, Peroxisomal membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxmp4Q9JJW0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pxmp4Q9JJW0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pxmp4Q9JJW0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms