Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6l2Q9JIM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc6l2Q9JIM3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms