Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copb1Q9JIF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Copb1Q9JIF7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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