Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtaQ9JHK4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtaQ9JHK4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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