Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exosc9Q9JHI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Exosc9Q9JHI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exosc9Q9JHI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms