Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan1Q9JHG6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rcan1Q9JHG6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan1Q9JHG6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms