Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc28a3Q9ERH8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms